[RecordSync有効]オプションにチェックが入っている可能性があります。

この機能は、CreativeMedia Sourceの再生リストに登録された音楽ファイルの再生と同時に録音を行います。外部入力の音声と録音がシンクロする機能ではありませんので、S/PDIFなどからの入力を使って録音を行う場合には、このオプションを無効にしてください。